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頭孢拉定屬于第一代頭孢菌素，頭孢克肟屬于第三代頭孢菌素，頭孢拉定的藥效跟頭孢克肟比相對要弱一些，頭孢拉定的抗菌譜更廣一些，頭孢克肟針對性更強一些，更窄一些，兩者就有這樣的區別。
但其實所針對的敏感菌基本上都是一致的，在臨床應用當中主要是針對敏感菌導致的一些感染，另外頭孢克肟藥效更確切，藥物純度更高，針對性更強，針對一些比較嚴重的感染可以選擇頭孢克肟，前提是敏感菌導致的感染比如骨髓炎、敗血癥、細菌性肺炎。
感染比較重的時候建議選擇頭孢克肟，但是一般的腸道感染、泌尿生殖系統感染、呼吸道感染、皮膚軟組織感染，輕度以及重度的感染建議選擇頭孢拉定，頭孢拉定的抗菌譜更廣一些，藥效也是比較確切。
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